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伪彩和校准尺（Calibration bar）是清晰明确地展示图像数据的重要工具。


伪彩（Pseudo-color）图像，其本质是仅具有单个通道的灰度图像，通过“查找表”（Look Up Table，LUT），根据灰度值分配给每个像素以颜色，从而呈现彩色。



伪彩反映的是灰度值的差异，而不是已成像样本的颜色差异：


▲T1结构图，左侧为原始灰度图，右侧加了Fire样式的伪彩

真彩色（Genuine color）图像，例如通常所说的RGB图像，是指由R（Red）、G（Green）、B（blue）三个基色分量组成的彩色图像，反映了真实的颜色：

▲树叶RGB图片，可以分为RGB三个通道





伪彩本质是把灰度值与颜色之间做一个映射，不同的Look Up Table（LUT），具有不同的映射关系，可以通过 Image -> Color -> Display LUTs 查看：


▲Fiji自带的LUT


这种映射关系通常可以通过Calibration bar展示出来，从而清晰表明图像颜色与数值之间的关系，如下图所示，0~255的灰度值，根据LUT的不同，可以对应不同颜色：


▲常用的几种LUT


这篇文章会介绍怎样为图片增加伪彩以及Calibration Bar，以及添加伪彩时的注意事项。





以绿色通道的神经元图片为例，为图像增加Fire样式的伪彩以及Calibration Bar：